直至崇祯元年（1628年）六月，明王朝任命朱燮元为兵部尚书，赐尚方宝剑，加官少保，担任云、贵、川、湖、广西军务兼贵州巡抚，负责平叛，战事有了较大转变。

崇祯二年（1629年）四月，朱燮元谴贵州总兵许成名等由永宁出兵收复赤水卫（今四川叙永县赤水河镇），揭开了与叛军主力决战的序幕。

同年8月，在四川巡抚朱燮元，四川总兵官侯良柱，贵州巡抚王三善等联合作战下，斩安邦彦、奢崇明及叛军头目一百四十三人，基本消灭了叛军主力，时称“西南奇捷”。

崇祯三年春，剩余的残兵败将被彻底消灭，至此，“奢安之乱”彻底结束，西南的两大土司势力被铲除。

当然，按照另一种历史叙述方式来讲这段历史，永宁土司奢崇明是因为不堪忍受流官刁难（主要是向他要钱），不得不率领四川百姓揭竿而起。

不管历史真相是什么，不得不说，这位土司老爷造反的时机真是恰到好处。

天启元年的大明算不上多么太平，萨尔浒刚刚惨败，陕西民变已经出现苗头。

这时候土司老爷们在西南再一闹，搞不好让大明分崩离析也是有可能的，

其实奢崇明的想法很简单，也很纯粹。

他只是想走杨应龙、丰臣秀吉等人走过的老路，趁着明国“四面楚歌”时，临门给他一脚。

刘招孙对奢安之乱了解甚少，只知道这场仗断断续续打了十多年，叛军和明军打到最后，粮草断绝，到了吃人的地步。

贵阳城中，人肉直接明码标价，一斤人肉卖到五钱银子。